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369
一、 用途:
SpectraScan-R是一套專用于離體(ex-situ)根系VIS-NIR波段光譜掃描成像分析的儀器系統(tǒng),完整植物根系取土后可直接進(jìn)行可見(jiàn)光近紅外高光譜掃描成像分析,還可以進(jìn)一步經(jīng)過(guò)洗根后掃描成像然后通過(guò)專業(yè)軟件進(jìn)行根系分析,可以分析根系長(zhǎng)度、直徑、面積、體積、根尖記數(shù)等,還可以分析新生根系、根系水分分布、根系生化結(jié)構(gòu)二維時(shí)空分布成像等,甚至可以通過(guò)高光譜技術(shù)二維成像分析根系土壤基質(zhì)有機(jī)碳、水分含量等時(shí)空動(dòng)態(tài)變化。功能強(qiáng)大,操作簡(jiǎn)單,軟件可分析植物根系的形態(tài),色彩、分級(jí)伸展分析及根系的整體結(jié)構(gòu)分布等等。可廣泛應(yīng)用于植物根系動(dòng)態(tài)、植物表型分析、植物脅迫、土壤生態(tài)修復(fù)、濕地監(jiān)測(cè)等領(lǐng)域。
二、 原理:
SpectraScan-R根系分析系統(tǒng)利用高質(zhì)量RGB圖形掃描儀及高光譜成像系統(tǒng),獲取高分辨率植物根系可見(jiàn)光圖像及高分辨率光譜數(shù)據(jù),然后通過(guò)專業(yè)分析軟件對(duì)根系形態(tài)結(jié)構(gòu)、光譜特征、生化組成等進(jìn)行分析。掃描儀在掃描面板下方和上蓋中安裝有專門的雙光源照明系統(tǒng),并且在掃面板上預(yù)留了雙光源校準(zhǔn)區(qū)域。掃描時(shí),掃面板下的光源和上蓋板中的光源同時(shí)掃過(guò)高透明度根盤中的根系樣品,這樣可以避免根系掃描時(shí)容易產(chǎn)生的陰影和不均勻等現(xiàn)象的影響,有效地保證了獲取的圖像質(zhì)量。
WinRHIZO軟件可以讀取TIFF,JPEG標(biāo)準(zhǔn)格式的圖像。針對(duì)獲取的圖像,利用插入加密狗解密的軟件,同時(shí)配合廠家針對(duì)掃描儀配置的Scanner.cal校準(zhǔn)文件,對(duì)掃描獲得的高質(zhì)量根系圖像進(jìn)行分析。采用非統(tǒng)計(jì)學(xué)方法測(cè)量計(jì)算出交叉重疊部分根系長(zhǎng)度、直徑、面積、體積、根尖等基本的形態(tài)學(xué)參數(shù);利用軟件的色彩等級(jí)分析功能、高光譜成像分析,還可以對(duì)根系RGB、近紅外光譜進(jìn)行分析,從而進(jìn)行根系存活數(shù)量、水分、根系生長(zhǎng)和營(yíng)養(yǎng)狀況、土壤基質(zhì)等方面進(jìn)行分析研究;利用軟件的高級(jí)分析功能,還可以對(duì)完整的植物根系圖像進(jìn)行根系連接分析(研究根系分支角度、連通性等形態(tài)特征)、根系拓?fù)浞治觯ㄑ芯扛颠B接數(shù)量、路徑長(zhǎng)度)和根系分級(jí)伸展分析(記錄根系整體等級(jí)分布情況)。從而滿足研究者針對(duì)植物根系不同類別和層次的研究。
三、 組成:
1、 圖像撲捉系統(tǒng):經(jīng)過(guò)廠家調(diào)試的標(biāo)準(zhǔn)根系掃描設(shè)備,匹配專門的光源、具有**校正特點(diǎn)、根系固定裝置等
2、 高光譜成像分析單元,對(duì)根系及土壤基質(zhì)進(jìn)行高光譜成像
3、 根系分析系統(tǒng):基本版 /標(biāo)準(zhǔn)版 /專業(yè)版WinRHIZO分析軟件
4、 電腦(*低配置:Pentium III/64 MB內(nèi)存/17"顯示器)用戶自備
光譜掃描設(shè)備類型及區(qū)別見(jiàn)下表:
STD4800 | LA2400** | VIS-NIR | NIR | |
描述 | RGB高質(zhì)量高速掃描儀 | RGB多功能、高速掃描面積大的掃描儀 | 400-1000nm波段高光譜掃描成像 | 900-1700nm近紅外波段高光譜掃描成像 |
可否在野外使用 | N | N | Y | Y |
是否需要電腦操作 | Y | Y | Y | |
分辨率DPI(點(diǎn)/英寸) | 4800 | 2400 | 512x512,或1024x,可選配更高分辨率 | 640x |
掃描速度 | 較快 | 快 | 330fps | 670fps |
**掃描面積cm | 21.6x28 | 30x43 | 可局部或任意大小完整根系 | |
是否可對(duì)土壤基質(zhì)掃描 | Y | Y | ||
是否適合WinFolia | Y | Y | ||
是否適合 WinRHIZO | Y | Y | ||
是否適合 WinSEEDLE | Y | Y | ||
是否適合 WinDENDRO | Y | Y |
**WinRhizo Pro版本包括藍(lán)色背景板
四、 基本技術(shù)指標(biāo):
1、不同版本WinRhizo主要技術(shù)指標(biāo):
整體參數(shù) | 基本版 | 標(biāo)準(zhǔn)版 | 專業(yè)版 | 擬南芥版* |
總長(zhǎng) | Yes | Yes | Yes | Yes |
平均直徑 | Yes | Yes | Yes | Yes |
總面積 | Yes | Yes | Yes | Yes |
總體積 | Yes | Yes | Yes | Yes |
根尖、分叉和交疊計(jì)數(shù) | Yes | Yes | Yes | Yes |
根直徑等級(jí)分布參數(shù) | ||||
長(zhǎng)度 | No | Yes | Yes | Yes |
面積 | No | Yes | Yes | Yes |
體積 | No | Yes | Yes | Yes |
根尖計(jì)數(shù) | No | Yes | Yes | Yes |
* 擬南芥版具有專業(yè)版所有功能,另外還可針對(duì)擬南芥類植物的細(xì)小、交叉根系進(jìn)行測(cè)量
2、VIS-NIR光譜掃描成像分析:
1) 高光譜掃描成像分析波段:400-1000nm(標(biāo)配),可選配900-1700nm或1000-2500nm短波紅外波段
2) 智能一體式高光譜掃描成像技術(shù)(標(biāo)配),內(nèi)置自動(dòng)推掃系統(tǒng)、取景器相機(jī)等,高度便攜,集光譜成像數(shù)據(jù)采集、可視化數(shù)據(jù)處理、觸摸屏與控制鍵等于一體,采用圖形用戶界面(GUI)
3) 高光譜分析軟件采用SAM算法及Savitzky-Golay濾波器技術(shù),可創(chuàng)建類別或分級(jí)模型并建立App直接導(dǎo)入高光譜成像儀使用,建議同時(shí)選配ENVI軟件
4) 取景器相機(jī)分辨率5Mpix,高光譜成像空間分辨率512x512(標(biāo)配),可選配1024x或其它分辨率高光譜成像分析
5) 4.3”觸摸屏、13操作鍵(標(biāo)配)
6) 光譜分辨率7nm(標(biāo)配),波段數(shù)204(標(biāo)配)
7) 標(biāo)配視野31度,成像距離15cm至無(wú)窮遠(yuǎn),1m距離成像視野55x55cm
8) 具備默認(rèn)模式、自動(dòng)篩選模式、客戶定義APP模式及自動(dòng)時(shí)間間隔記錄模式
9) 根系RGB顏色分析(專業(yè)版RGB掃描分析軟件):根的長(zhǎng)度、面積、體積、根尖計(jì)數(shù)、根系存活數(shù)量等研究(對(duì)根系或者根系附著菌種顏色進(jìn)行分類,如健康根、淺程度受害根、重程度受害根等,軟件可計(jì)算每種顏色根系的總長(zhǎng)、總表面積、總體積、總根尖數(shù)量;每種顏色根系的平均長(zhǎng)度、平均表面積、平均直徑等)
10) 根系連接(link)分析(專業(yè)版RGB掃描分析軟件):用于根系分支角度、連通性等形態(tài)研究(與拓?fù)浜桶l(fā)育分析**的區(qū)別是,link分析可以針對(duì)非完整根系!軟件給出的結(jié)果有分析對(duì)象的根系平均直徑、平均長(zhǎng)度、平均表面積、每個(gè)分叉角度的平均值;分叉的總數(shù)量;每個(gè)分叉的長(zhǎng)度、表面積、平均直徑、角度、級(jí)別等)
11) 根系拓?fù)?/span>(Topology)分析(專業(yè)版RGB掃描分析軟件):連接數(shù)量、路徑長(zhǎng)度等研究(需要根系完整)(必須是要完整的根系掃描圖像。軟件可計(jì)算主根的長(zhǎng)度、所有次級(jí)根的總長(zhǎng)度、平均長(zhǎng)度、平均直徑、平均表面積;每一級(jí)分叉的下級(jí)總分叉數(shù)量;每一級(jí)分叉的總數(shù)量等)
12) 根系發(fā)育(Development)分析:記錄根系整體等級(jí)分布情況(可通過(guò)專業(yè)版分析軟件需要要完整的根系掃描圖像。軟件可計(jì)算每一個(gè)分級(jí)根系總長(zhǎng)、總表面積,平均長(zhǎng)度、平均直徑、平均表面積等)
五、 產(chǎn)地:客戶定制集成技術(shù)