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田間全天候、全自動監測植物表型!
高通量田間植物表型平臺FieldScan是專為田間表型研究設計的高通量植物表型平臺,可在任何環境條件下全天候測量。根據系統設計的大小,一套系統每天可測量上萬株植物,每小時通量可達5000株植物,可實現對植物生長和蒸騰(結合稱重系統)的精確測量,特別適合應用于抗旱或其他表型性狀的大規模篩選。不僅可直接掃描種植在田間土壤的植物,同時還可掃描盆栽植物。在采用盆栽植物培養時,可根據壓力傳感器跟蹤每株植物的重量,計算其蒸騰速率。
設計理念-在高通量與準確性之間平衡
在現代植物研究與育種中,田間表型是表型組學*亟需發展的領域之一,一直面臨著各種挑戰。例如從全日照到夜間,溫度的巨大變化和降雨等外界環境不僅影響測量技術,同時對植物也可能產生很大的影響。因此,對測量技術來講,需要設定非常合理的信噪比以準確地獲取表型信息;同時也需要在有限的時間段里,高通量地獲取植物的表型信息;當然對環境因子的同步監測也十分必要。
在開發FieldScan時,我們的目標是提供一套可在任何環境下使用;每天可進行多次掃描;同時可剔除低質量數據的田間表型獲取系統。如果側重通量和靈活性,我們可以在田間使用拖拉機或UAV等移動設備。但為了獲得毫米級的高精度測量,我們決定不再使用這些傳統移動設備,而高精度的測量僅適用于固定式的系統。為此我們需要開發一套能同時滿足高精度和高通量的移動平臺。 FieldScan的設計,采用移動式激光3D植物表型平臺 PlantEye作為核心,并集成了其它多種傳感器。PlantEye用于獲取植物生長情況。通過3D的頂部成像,不僅能獲得葉面積、葉傾角、冠層等參數,同時還能得到相對于其他技術更高的精度和通量。當然在需要時,也可以集成其他傳感器。在任何光照情況下,FieldScan都能在不影響植物本身生長的情況下,每天能對上萬株植物(取決于系統大小)進行10次重復測量,為用戶提供有價值的數據,方便了解植物在田間的生長情況。
技術原理
同時集成氣象等其他因子傳感器,對植物生長環境進行同步測量
應用領域
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主要功能
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測量結果示例
共集成了8臺PlantEye,每小時可以對2000-3000株植物進行表型分析,一天的通量可以達到12000株。該系統將精準灌溉、表型分析、環境氣象等參數集成到一起,由PhenoSpex的軟件系統進行全方位自動控制。
植株高度和分辨率
對PlantEye傳感器而言,其測量的植株高度范圍很廣,但是對于不同高度的植株需要做一些校正。植株越小,分辨率越高;植株越大,分辨率越低。例如測量高度在0-30 cm的植株,分辨率為0.2 mm;測量高度在0-70 cm的植株,分辨率為0.4 mm;測量高度在0-120 cm的植株,分辨率為1 mm。更高的植株也可以測量,只是分辨率稍有下降。
軟件系統
測量結果舉例
獲獎
核心傳感器PlantEye系統榮獲如下獎項:
代表用戶
國際上很多的客戶與PhenoSpex公司簽有保密協議,不允許后者公開客戶信息。這里僅僅列出了很少的一部分允許公開的用戶信息。
國際熱帶半干旱地區作物研究所(ICRISAT),用于珍珠粟(pearl millet)、高粱、花生、鷹嘴豆等的超高通量表型測量,進行抗旱研究。
Jülich研究中心(Research Center Jülich),歐洲**的科研機構之一,主要做甜菜和其它作物的表型研究。
瓦赫寧根大學,全球***的農業大學之一,主要用于甜椒、紅掌等的早期脅迫監測。
世界**的特種肥料制造商Everris公司,用于緩釋肥料的研發和作物管理。
德國Compo公司 (肥料公司) ,用于協助作物提高抗旱性和抗鹽性的肥料篩選。
波恩大學,用于田間小麥和大麥的高通量表型測量。
奧胡斯大學(University Aarhus),丹麥排名第二的大學,用于菊花、小麥和歐洲油菜(Brassica napus)的表型測量。
園藝領域
在園藝領域,通過調節施肥、生長調節物質、環境控制等方法可以改進、優化植物生長和作物管理。植物表型平臺PlantEye和管理軟件DocTool的結合使用有效優化作物管理,降低風險。下面列出的這些用戶,采用這套方案大大降低了資源和成本的消耗,顯著提高了產量。
荷蘭安祖(Anthura)公司,世界**的種苗生產企業,總部位于荷蘭布雷斯克,主要從事紅掌屬植物和蝴蝶蘭的育種與繁殖、盆花和切花種苗生產,在國際市場占有重要的地位。
德國Blumen Rieke公司
德國Koster公司
其它不允許公開的用戶……
主要技術參數
通量:5000株/小時
集成傳感器:PlantEye,溫濕度傳感器, 光合有效輻射傳感器,風速風向傳感器,雨量傳感器, 負壓傳感器 (用于計算蒸騰,僅限盆栽)
測量的植物高度和分辨率:高度0-1500 mm,分辨率0.2-1.0 mm;其它植物高度可定制
傳感器到植物的距離:*小350-650 mm,**1100-2200 mm
掃描波長:700-1100 mm
測量速率:每秒50個XZ輪廓圖
信號接口:IN/OUT觸發信號接口
觸發選擇:感應開關,RFID,光學二維碼,外部信號(如定位系統),其它選擇可定制
測量參數:高度(平均高度和**點)、獨立葉面積、總葉面積(冠層面積)、投影葉面積、蓋度、植物數目、葉片數目、葉片傾斜角PHI(Φ)、葉片方位角THETA(θ)、蓮座狀植物(rosette plants)的直徑、植物體積、蒸騰速率、溫度、濕度、風速風向、雨量、光合有效輻射等
數據下載:允許下載3D點陣云圖(原始數據)、植物生長數據和高度柱狀圖等。
數據傳輸:通過Wifi無線傳輸
數據壓縮:自動壓縮
遠程訪問:支持通過>遠程訪問(ssh協議)
工作溫度:0-50℃
工作濕度:<90% RH
供電:12 VDC、24 VDC、230 VAC均可
激光安全等級:1M
光環境:耐受全日照輻射
防護等級:IP67
數據庫:PostgreSQL數據庫
PSX低通量方案:準系統電腦(Barebone computer)
PSX超供通量服務器方案:1U Intel Dual-CPU服務器(8 cores x 1GHz), 8 GB;3 x 2000 GB硬盤;RAID 5控制器;1.5 TB磁帶驅動器
HortControl數據管理系統
工作界面:通過瀏覽器登錄工作
軟件界面:提供不同界面用于數據自動導入,用于集成導入其它環境或植物傳感器的數據
數據下載:允許下載數據(ASCI)進行進一步分析,允許導入/導出數據庫
檔案功能:具備檔案錄入、顯示,作物管理、實驗管理功能
統計功能:數據平均值和偏差值的統計分析
上載功能:能夠上載高通量平臺的實驗設置信息
報警功能:數據異常時報警
2D Mapping功能:對不同生長區域進行2D Mapping,用于定量分析